ABOUT THIS RECORDspecies: Gossypium raimondii
source: PMRD, original name: gra-miR160b
Taxonomy by NCBI:
Gossypium raimondii Gossypium Malvoideae Malvaceae Malvales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGCCTGGCTCCCTGTATGCCT miRNA* GCTACGAGAGAGCTGCTGC mismatches: 4 bulges: 4 |
pre-miRNA
AACAGCTACGAGAGAGCTGCTGCTCAGTAAGTATCGGCTGACCAAAGAGTAAAAACTGGTGTCTTTTTGTGTTGCCAGATTTCTCATTCACATTAGAATT
CCCGATTGTTAACAAGCAAGAAAGATTATCAGTACCATTAGGGCGCCTTGCCATCATGATGCCATCGGAAATTCTAGAGTGGGGATCGAACCGCTGGAAA
CCGGGCAGAAAAAGTCCGGACTGCAGTTTATTATTAAGATGGAGATCGGATAAAGATAACCCAAATTGAGCATGCCTGGCTCCCTGTATGCCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase far-MIR160: 0.00002 PMRD gra-miR160a: 0.0000000000003 microPC miR160: 0.001 | UniProt sp|Q653H7|ARFR_ORYSJ: 4e-18 RFAM mir-160: 0.0003 |
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