ABOUT THIS RECORDspecies: Saccharum officinarum
source: PMRD, original name: sof-miR156h
Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGACAGAAGAGAGAGAGCAC miRNA* GCTTGCTGTCTGCATA mismatches: 2 bulges: 4 |
pre-miRNA
GTGCTTGCTGTCTGCATAAGGTCCAGCGTCGTGTGCCACGCACCGGGCGGCGCCACGTGGTACCGGCCACCGCCAACGCCACTGTGGGGGTGCGGGCGCC
AGCTGCTGGCTGCCTGATCGGGCAGCGGGAGGGCGCAACCCGCCGCCGACGAAGAGGCAAAATGCTGGCCGGGCGCCGATGAGCGGTCCGACAAGTACTG
CCACGCGAGGAGTGAGGCGCGGTTCTCGGCGATAAGGTCGTCGAGCGCCGCGCTGGAGCGCGCGGAGATGTCCGGCGTCGTGACCAGCCAGGGAGCACCG
CTCGCCGCGCCGCCTCTGGCCGATGACAGAAGAGAGAGAGCAC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase zma-MIR156j: 0.00002 PMRD zma-miR156j: 0.00002 microPC no hits | UniProt sp|Q01JD1|SPL7_ORYSI: 0.000000000000002 RFAM no hits |
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