ABOUT THIS RECORDspecies: Saccharum officinarum
miRNA family: MIR319
source: PMRD, original name: sof-miR319a
Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGACTGAAGGGTGCTCCC miRNA* GTGCTCCCTCCTCCCGGCCTCCTTTGTTTACTTTACCCATGCGCAGCTTCATCATATCTCAGGG mismatches: 7 bulges: 509 |
pre-miRNA
TTGGACTGAAGGGTGCTCCCTCCTCCCGGCCTCCTTTGTTTACTTTACCCATGCGCAGCTTCATCATATCTCAGGGTTTTACTTCATGATCTGTATTTAT
TTTCCAACCTGCTGTCTTGAACTCTTGATCTGTCTTTGCTTGAGCTGCTTAATTATTATCTTATATATTTCTTTGGCATCTGCTGCATATATATGCAGCA
GCTGCCAAACTACGGGCCTATTTTAATTTTATCATGTGCGTGCTTACTGTTCTTCTCTGGCTGTTATGTAGCAGTTGTATATATAATCGAGATCCAAAGC
TTTTTGTACTTTCCTTGCCCTTTTTTGATATATATACTAGCTATAAATCCTTGATCTGCTAGCTGAATCTATATATTGTTCTCTTCCAAAAAGAGATCCC
ATAGTTTCAATTTGCTTTACTTGTGTGTAGATCTTACAGGACATGATCGGATCCATACATCGATGCATCGTCTCTGCAGGTTTCTGCTGTGTATTTCTGT
GATCTGTGGAAGAAGGTGGTGTGCACTGTTGTGGTCTAG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase sbi-MIR319: 0.00000000003 PMRD sbi-miR319: 0.00000000003 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR159: 0.000002 |
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