ABOUT THIS RECORDspecies: Artemisia annua
miRNA family: MIRf599
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Artemisia annua Artemisia Artemisiinae Anthemideae Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GCTGGGATTACAGGCATGAGC miRNA* TCATGTCTGCAATCCCAGCAC mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
CAAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCCCCATGCCCAGCCTCTGAATCATTTTCTTTAGGTTAGCAAACTATTC
GGCCAGATCTTTTAAATACATGAATGCTTTATTGCTTTGTTTTCCTTTAACTCATTCTGTTCTCCACACTCATTTAAGGAGACAAGTCTGTTCATTTCTC
CACCAGATACATTTTACTGTAGGATTTGGGAGTGACAAAGCCGCGAGTCATTTAAACAGCGGGGTTGCATGGCTCAGAAGAGTTGACTACTCACATAAGT
CAGTGTATTGGCGGAGGAGGAAAAATACTCCTTTAAATACGAGTAATAAAACAATATTAAAAGTAGACCAGGCTGGACGCAGTGGCTCATGTCTGCAATC
CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGTAGATCACA
dot-bracket secondary structure
......(((..((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((....(((((((((...(((.....)))....((((.((..(((.(((
(((((((((((.....((.((((.(((......((((((((.((((..((.((....(((.((((............))))))).(((((..........
...)))))(((......))).)).)).))))..)))))))).)))..)))).))......))))))...)))))..))).)))(((((.........)))
)).((((((...(((((((........))))))).))))))..(((((......)))))...)).)))).))))))..)))..)))))))))))).))))
))))))).))))))))))))).))))..)))....
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
CAAGAAATCCTCCCACCTCAGCCTCCCAAGTGCTGGGATTACAGGCATGAGCCCCCATGCCCAGCCTCTGAATCATTTTCTTTAGGTTAGCAAACTATTC
GGCCAGATCTTTTAAATACATGAATGCTTTATTGCTTTGTTTTCCTTTAACTCATTCTGTTCTCCACACTCATTTAAGGAGACAAGTCTGTTCATTTCTC
CACCAGATACATTTTACTGTAGGATTTGGGAGTGACAAAGCCGCGAGTCATTTAAACAGCGGGGTTGCATGGCTCAGAAGAGTTGACTACTCACATAAGT
CAGTGTATTGGCGGAGGAGGAAAAATACTCCTTTAAATACGAGTAATAAAACAATATTAAAAGTAGACCAGGCTGGACGCAGTGGCTCATGTCTGCAATC
CCAGCACTTTGGGAGGCTGAGATGGGTAGATCACA
dot-bracket secondary structure
......(((..((((.((((((((((((((((((((((((.((((((((((((....(((((((((...(((.....)))....((((.((..(((.(((
(((((((((((.....((.((((.(((......((((((((.((((..((.((....(((.((((............))))))).(((((..........
...)))))(((......))).)).)).))))..)))))))).)))..)))).))......))))))...)))))..))).)))(((((.........)))
)).((((((...(((((((........))))))).))))))..(((((......)))))...)).)))).))))))..)))..)))))))))))).))))
))))))).))))))))))))).))))..)))....
SIMILARITIES| miRBase hsa-mir-619: 0.00000000002 PMRD ptc-miRf12412-akr: 0.000001 microPC no hits | UniProt no hits RFAM Metazoa_SRP: 8e-18 | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
