ABOUT THIS RECORDspecies: Raphanus raphanistrum subsp. landra
miRNA family: MIR824
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Raphanus raphanistrum subsp. landra Raphanus raphanistrum Raphanus Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TAGACCATTTGTGAGAAGGGG miRNA* CCTTCTCATCGATGGTCTAGA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGACAGGTTCGCTCGAGTTGTCTCTCATGTCTAGACCATTTGTGAGAAGGGGTTTTATAGGTGCACCTCACCAATCTCTAAATGACTAAATATACGATTA
GTATTAGGCTCATATAAGGAAGTTAACTTCTATACATAAAGTGCACTGATGACTTTTCCAGATGCTATATAGATACTTTTTAGAATTAGGTCATGCCAAG
TCTCCAACTCATATATAATCGTATACACTTTTGGACATACATTTTCTCTAAGAGATGCCAAACTTCTGTCTGGAGTGGAGCTTTCTCGTGATAGCTCATA
ATTTGTAGCTTGCACAACTTAAGCTACACTAGTTTACTTGATAAAAAAATTGAGTGGAGTGGGGGGGAGGTGCTGGATTATTTCCCCTTCTCATCGATGG
TCTAGATTTGCGAGGTGACTCTAATAGTGGTAAA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase bra-MIR824: 0.0000000000001 PMRD bra-miR824: 0.0000000000001 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR824: 0.000000000002 | most similar mature miRNAs |
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