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Species belonging to selected taxon:

Agrostis stolonifera, Allium cepa, Oryza sativa, Avena barbata, Avena sativa, Curcuma longa, Cynodon dactylon, Dioscorea alata, Elaeis guineensis, Eragrostis curvula, Festuca arundinacea, Festuca pratensis, Hordeum vulgare, Hordeum vulgare subsp. spontaneum, Leymus cinereus x Leymus triticoides, Lolium perenne, Musa ABB Group, Panicum virgatum, Pseudoroegneria spicata, Saccharum hybrid cultivar CoS 767, Saccharum hybrid cultivar SP70-1143, Saccharum officinarum, Sorghum propinquum, Triticum monococcum, Triticum turgidum subsp. durum, Zingiber officinale, Cenchrus ciliaris, Brachypodium distachyon, Zea mays, Triticum aestivum, Sorghum bicolor



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002846
species: Zingiber officinale
miRNA family: MIRf756
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Zingiber officinale Zingiber Zingiberaceae Zingiberales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 AGATCATCTGGCAGTTTCAAT

miRNA*
 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGG

mismatches: 1
bulges: 1
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pre-miRNA
 TAAATTGTTGGAATGAAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTCATGTAGTTCCTTCTGCTTGCTTTTTCTTTGAAAGTTTTTCGCAAAAAAAAAAGA
AGTCATCTTTCGAGTGTTTAATCGCATCAATTCTTTTTTCACGTCGTAACTAGTTTTAAGTTTCTCCTTCTTCTCTCCTTGTTATCTCTATATTAAATCT
TCGAAATGAATTCTGCAGGGTTTCAATCTGATTTCTATTAGAAAAGAAAAGAAACAAAAAAAAAAAAATATTAGTGTTTGTGATTGGAGGTACCTGTGGA
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TGATCAATTAATTAAATCAAGAGGGCGAAGAGGAGGAATTCCTTGTTTTCATTTCATCAGATCATCTGGCAGTTTCAATCCCTCAATTTCCCAACAGA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase sbi-MIR167c: 0.000000007

PMRD vvi-miR167a: 0.000000007

microPC miR167: 0.00003		UniProt no hits

RFAM MIR167_1: 0.0000001		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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