ABOUT THIS RECORDspecies: Brachypodium distachyon
miRNA family: MIR437
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brachypodium distachyon Brachypodium Brachypodieae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGAAGTTTGACTCAGGACAAA miRNA* TGCCCTAAGTCAAACTTTTTA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
CCTTTGTTCTTAAATATAAGATGTTCTAGTTTTGCCCTAAGTCAAACTTTTTAACGTTTGACCAAATTTAGAGAAAAATGTACTGACACCTACAATATCA
AATAAGTATACTATGAAGATATTCATCGTAATTTAGAGTTGTAGATGTTGGGAAAAATTATATAAACTTGGTCAGACTTTAACTTTAGGAAGTTTTTTTT
TTCAGGAATAAACTTTAGGAAGTTTGACTCAGGACAAAGCTTGAACATATTATATTTAGGAAAACTT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase bdi-MIR5169: 0.00000006 PMRD osa-miR437: 0.00005 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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