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Species belonging to selected taxon:
Agrostis stolonifera
,
Avena barbata
,
Avena sativa
,
Festuca arundinacea
,
Festuca pratensis
,
Hordeum vulgare
,
Hordeum vulgare subsp. spontaneum
,
Leymus cinereus x Leymus triticoides
,
Lolium perenne
,
Pseudoroegneria spicata
,
Triticum monococcum
,
Triticum turgidum subsp. durum
,
Brachypodium distachyon
,
Triticum aestivum
ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST001016
species:
Hordeum vulgare
miRNA family:
MIRf99
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Hordeum vulgare
Hordeum
Triticeae
Pooideae
BEP clade
Poaceae
Poales
commelinids
Liliopsida
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
CGAACCGAACCGAACCGAACC
miRNA*
ATCGTACGGTCGGTACGGC
mismatches:
3
bulges:
2
View larger
pre-miRNA
ACGCAACGAAA
CGAACCGAACCGAACCGAACC
AGGCCAATCCAACCCGTCGCCTCTCCCTCTCCTCTACTCTCGGCTGCGAATTAAACCCACCCCGCGAA
TCCTTCGATTCCGGTTCCTCTTCCTCTCTCGCAGCGCGGCGCGAAGCAACCAATCAATGGCGGTGGCGTCGGGACCCGCGGCCACGTTCTCTGCCAGGGG
CCTCCCCGCGGCGCCGGGCGCCGGCCGGCCCTGCTCGTGCGCCGCCGCGGCCACCGGCGGGGCGAGGTTCCGCGGCGCCGACGGGAAGTGGTGGGCGCCG
CTCCTCGGGTGGGCGGGCCAGCCCCACTACATAGACGCCCAGCCGGCGCCCGCACCGGCGACGGAGGAAGAGCGGGCTGCTGGAAGTGGAGCCGGGGCCA
AGCCGGATTGGACTGTCTCACGCTGAGAATGGCCCGTGCGATGATGATGTGGGAGGGTGGGAGCTCAGGGGTTAGAAGAGACTGTTGTACGAGTGTGGGT
ACTCGTCGTCGTAAAGGTGTACTGCGCGGCCAGGTGGAATGACCCCGACACTCGTGGTACTGCAAGACCACCCGGTGTTATGCGAACTCTAAGAAGAGGA
CGTTGAGGAGCCTGAGCTATGACGAAGAAGACCGCGGAGCTAGTAGAAGCGGGTTCGAGGAGGACGTGGAAGGGAGGAGGTTTAATGTGGGAGAAGGTAG
CATGGAACGATGACGGAGGAAGTACGTCTGAAGGTCGGACTATGGAAGGAGCATGCACTTAGTATGGACGAATGTATGGTACGAGGATGATCGAAAGGAG
TCTGTGTAGGAACGTGACGAGTTGGTACTGTCGGACGCATGACGCGTACGTAGTAAGAACGTCTGAAGTTACCCAGGTCTGGAGGCACGG
ATCGTACGGT
CGGTACGGC
T
dot-bracket secondary structure
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ptc-miRf11108-akr
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