ABOUT THIS RECORDspecies: Solanum lycopersicum
source: microPC, original name: miR159
Taxonomy by NCBI:
Solanum lycopersicum Lycopersicon Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTCT miRNA* AGCTCCTTGAAGTCCAACA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGAGCTCCTTGAAGTCCAACAAAAAATCTAACAGGTTAAATTGAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGCCCTATCTATTTATGATTTCAAACATATAGAT
AGGTTTGTGGGTTTGCATATGTCAGGAGCTTTATTTTACCCTTTGTTTGATCATTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase sly-MIR159: 3e-92 PMRD sly-miR159: 3e-92 microPC miR159: 4e-97 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-88 |
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