ABOUT THIS RECORDspecies: Brassica rapa
source: microPC, original name: miR159
Taxonomy by NCBI:
Brassica rapa Brassica Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GGGCTCCTTATAGTTCAAAC mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAGGGCTCCTTATAGTTCAAACGAGAGTTTAGCAGGGTAAAGAAAAGCTGCTAAGCTATGAATCCCATAAGCCCTAATCCTTATATATAAAAAGGATTTG
GTTATATGGCTTACATATCTCAGGAGCTTTAACTTGCCCTTTAATTGCTTTTACTCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA
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SIMILARITIES| miRBase bra-MIR159a: 2e-99 PMRD bra-miR159a: 2e-99 microPC miR159: 2e-99 | UniProt no hits RFAM MIR159: 4e-64 |
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