ABOUT THIS RECORDspecies: Citrus sinensis
source: microPC, original name: miR159
Taxonomy by NCBI:
Citrus sinensis Citrus Rutaceae Sapindales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGATTGAAGGGAGCTCT miRNA* AGCTCCTTGAAGTCCAAAAG mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGAGCTCCTTGAAGTCCAAAAGAGGTTCTAGCAAGGGTAAATTGAGCTGCTGAGCTATGGATCCCACAGTCCTATGTATCAGATTTTAGGGTTTGTTTCT
GATGATGGTGATGATAGGCTTGTGGCTTGCATATTTCTGGACCTTCATTACCCCTTAAGTTTTTACCCCTTTTTTTGGATTGAAGGGAGCTCT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase csi-MIR159: 1e-94 PMRD ptc-miRf10271-akr: 0.00000000000004 microPC miR159: 1e-94 | UniProt no hits RFAM MIR159: 2e-16 |
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