ABOUT THIS RECORDspecies: Citrus unshiu
miRNA family: MIR156
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Citrus unshiu Citrus Rutaceae Sapindales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGACAGAAGAGAGAGAGCACA miRNA* TGTTTTTTTTTTTTTTTTTTA mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
ACGGCATGACAGTGTTTTTTTTTTTTTTTTTTAACAACAAACCAACATTCTAGTCTTGAGAATAAGTTCATTGCAGCAGGATTTTCAAGAAGAGAATCCA
GAATTATTATATGGAAAGATAACAACCTCTTAGTGACTTACTACTCCCAATGAAAGGGAATTGTTTGAGGGGTATCACTGGCTGCGGACCCATCATATCC
CAAATGAAACACTCCAGGGCAATGAACATTATCATCCTGATCACTGGATACCAGAACAGATTCCATGGGCTCTACACTGTGATTATGCAGGCTTGTGCCC
AAGGACCGCACCAGTGGCATTGAACTAGGCGGCATCATTTGGCTCAAACTGATACCAGATGTCTGTGTTGTTGGTGATGACAGAAGAGAGAGAGCACAAT
CTGAGTC
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase sbi-MIR156d: 0.0000003 PMRD csi-miR156b: 0 microPC miR157: 0.00009 | UniProt no hits RFAM mir-156: 0.0004 | most similar mature miRNAs |
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