miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse

Species belonging to selected taxon:

Prunus armeniaca, Prunus persica



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002243
species: Prunus persica
miRNA family: MIR2592
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Prunus persica Prunus Amygdaleae Spiraeoideae Rosaceae Rosales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TTATGCTTGAGTCATGTTGAT

miRNA*
 TAATGTGAAGTCAAGTTTGGAT

mismatches: 4
bulges: 1
View larger
pre-miRNA
 AATCATGTGTGAAATCAAGGTTGGATGTGTGATGCTTATTGATAATGTGAAGTCAAGTTTGGATGAGTGCTCCTAACAAAATAAGATGTTTTTTTTTTTT
TTTTTCAATCAATAGAAGAAGGGATATTCGAACTAGGGTTAAAAAGAGAAAAAATATCATGCTCAGGGTTCATATTAATCCTTATTTTTATTTTGTTTTA
ATTAGTTGCTACTAGAATCTTACTAAAGGATAAGATTTGAAGTTATTGGTGGTGCAAGGAAATAATAAATTAGTTTTTGCGAGGAATATTTGCATTATGC
TTGAGTCATGTTGATGACGTTTGCACTGCTTAGTAAGCAGAATTGTTTGTTTGT

dot-bracket secondary structure
.((((((......(((.......))).)))))).........((((((((..((((((.(((.((((((.((((((((((((((((.((...((((((((
(((((.((((..(((..(((......)))...))).)))).)))))))))))))......))..((((((......))))))...))))))))))))...
((((((.(((....((((((((((...)).))))))))..))).))))))..((((((((..(((....))).)))))))))))).))))))..))).))
)))).))))))))..((((...(((((((((...))))))...))).))))...


SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
Source sequences
download this record




Liczniki na strone;