ABOUT THIS RECORDspecies: Helianthus annuus
miRNA family: miR3441.2
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Helianthus annuus Helianthus Heliantheae Heliantheae alliance Asteroideae Asteraceae Asterales campanulids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA AGAAGAAAAAGAAGTCGTTGA miRNA* CATAGCTCACTTGTTTTTGTTC mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
ATCAGTTCGCTCTGATCGATCCTTCAATCTTTGATTTCCATAGCTCACTTGTTTTTGTTCTTGATTCCATCTTTTCTTCAATTATGTCTAACGCAGCAGT
TTACCACGACGCCCCGAAAACCGAAGAGCCCTGCCAAACCACCACCACCACTGTGAAGGTTGAGCCTGAGGTCGTAGAACAATCCGATCGTGGGTTGTTT
GGTTTCGGGAAGAAGGACGAGGAGGAGAAGAAGTGCTAAGATGCCGTGATCTCGTCCGAGTTTGAACAGAAAGTTCAAGTGACTGAACCCGAACCTGAGG
AGAAGAAAGAAGGTTTGCTTAAGAAATTTCACCGATCTAATAGCAGTTCCAGCAGTTCTAGTGATGAGGAGTGCGAAGATGGAGAGAAGAAGAAGAAAAA
GAAGTCGTTGAAGGATAAGGTTAAGGAAAAGATCGAAGGGCACAAAGAAA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD ptc-miRf12467-akr: 0.0004 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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