ABOUT THIS RECORDspecies: Hordeum vulgare
miRNA family: MIRf719
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Hordeum vulgare Hordeum Triticeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GATTTGTCCACGTCATCACAA miRNA* TGATGATGTGGACAAATTCC mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
TATATATATTAGAAATTTAGAAACTACTGTTAGATAAAAAAAGGACGTTCGAGATTTGTCCACGTCATCACAAGTAAAAAGTTTACTCATGGATTTATTGA
TGAGTCACGGTGAAATTTTTACTATGATGATGTGGACAAATTCCGAACATCCATTTTCGATCCAATAGATGTTTCAAGTTTGTACCATATAT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR2862: 2.0E-7 PMRD osa-miRf11197-akr: 2.0E-13 microPC no hits | UniProt no hits RFAM 1MIR811: 5.0E-14 | most similar mature miRNAs |
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