Parental gene:

ENSCJAG00000018026

Aliases:None
Description:None
Organism:Marmoset (Callithrix jacchus)
Coordinates:11:119873587..119874254(-)


>ENSCJAG00000018026
ATGAAACTGCTCACCCACAATCTTCTGAGCTCGCATGTGCGAGGGGTGGGGCCCCGAGGCTACCCCCTGCGCCTCCAGGC
CACGGAGGTCCGCATCTGCCCCGTGGAGTTCAACCGCGAATTCGTGGCGCGTATGATACCCAAGGTGGAGTGGGCGGCGT
TCCTGGAGGCGGCGGATAACTTGCGCCTGATGCAGGTGCCTAAAGGGCCGGTTGAGGGGTATGAGGAGAATGAAGAGTTT
CTGAAGACCATGCACCACCTGCTGCTGGAGGTGGAAGTGGTGGAGGGCACCCTGCAGTGCCCGGAGTCTGGACGTATGTT
CCCCATCAGCCGCGGGATCCCCAACATGCTGCTGAGTGAAGACGAATCTGAGAGTTGA

Library Parental gene expression (RPM)
SRP051959_spleen 14 .10 RPM
SRP051959_skeletal_muscle 22 .97 RPM
SRP051959_lymph_node 13 .99 RPM
SRP051959_lung 13 .16 RPM
SRP051959_liver 21 .86 RPM
SRP051959_kidney 13 .56 RPM
SRP051959_heart 10 .61 RPM
SRP051959_colon 7 .97 RPM



Species Parental gene accession Homology type Retrogenes number
Ailuropoda melanoleuca ENSAMEG00000017965 possible_ortholog 3 retrogenes
Bos taurus ENSBTAG00000008646 possible_ortholog 1 retrogene
Canis familiaris ENSCAFG00000014445 possible_ortholog 1 retrogene
Dasypus novemcinctus ENSDNOG00000004644 possible_ortholog 1 retrogene
Equus caballus ENSECAG00000016960 possible_ortholog 1 retrogene
Echinops telfairi ENSETEG00000000263 possible_ortholog 4 retrogenes
Felis catus ENSFCAG00000023392 possible_ortholog 4 retrogenes
Homo sapiens ENSG00000173113 ortholog_many2many 4 retrogenes
Gorilla gorilla ENSGGOG00000001334 ortholog_one2many 3 retrogenes
Microcebus murinus ENSMICG00000016987 possible_ortholog 1 retrogene
Macaca mulatta ENSMMUG00000019647 ortholog_one2many 2 retrogenes
Mustela putorius furo ENSMPUG00000012911 possible_ortholog 2 retrogenes
Mus musculus ENSMUSG00000038812 possible_ortholog 468 retrogenes
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Nomascus leucogenys ENSNLEG00000004991 ortholog_one2many 4 retrogenes
Ochotona princeps ENSOPRG00000004130 possible_ortholog 2 retrogenes
Pongo abelii ENSPPYG00000025906 ortholog_one2many 5 retrogenes
Pteropus vampyrus ENSPVAG00000017134 ortholog_one2many 1 retrogene
Rattus norvegicus ENSRNOG00000021132 possible_ortholog 4 retrogenes
Sus scrofa ENSSSCG00000013029 possible_ortholog 3 retrogenes
Ictidomys tridecemlineatus ENSSTOG00000019857 possible_ortholog 1 retrogene
Tursiops truncatus ENSTTRG00000010299 possible_ortholog 2 retrogenes

# RetrogeneDB ID Identity (%) Coverage (%) ORF conservation Expression evidence RDV
1. retro_cjac_2995 73.91 72.80
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